Das Ziel der Preisvergabe, die gemeinsam durch die Universität Leipzig, die Sächsische Akademie der Wissenschaften und der Stadt Leipzig erfolgt, besteht darin, das Ansehen Leipzigs als einer Stadt der Wissenschaften zu stärken.

• Der Preis wird für Leistungen in allen wissenschaftlichen Feldern ausgeschrieben. Er kann sich sowohl auf grundlagen- wie anwendungsorientierte Forschungsarbeiten beziehen. (Universeller Forschungsbezug)
  
• Die Preisvergabe orientiert sich am Innovationsgrad einer wissenschaftlichen Arbeit, an der Qualität der Eröffnung neuer Sach- und Sichtweisen. (Innovationsbezug)
  
• Moderne Forschung zeichnet sich durch ihren grenzüberschreitenden Charakter aus: Sie ist interdisziplinär. Arbeiten, die sich dieser fächerübergreifenden Perspektive bedienen, finden besondere Berücksichtigung. (Modernitätsbezug)
  
• Wissenschaftliches Wissen beweist seine Unverzichtbarkeit in der Begegnung mit dem Alltag und der historischen Gegenwart der Menschen. Forschungsarbeiten, die sich als Lösungsvorschläge für aktuelle gesellschaftliche Probleme verstehen, sind besonders in Rechnung zu stellen. (Aktualitäts- und Problembezug)
  
• Forschungsarbeiten, die sich auf historische oder aktuelle Probleme der Region Leipzig beziehen, verdienen besondere Aufmerksamkeit. (sachlicher Regionalbezug)
  
• Der Preis richtet sich zunächst, aber nicht ausschließlich, an Wissenschaftler, die im Raum Leipzig arbeiten. Arbeiten auswärtiger Wissenschaftler, die sich "Leipziger Themen" beziehen, besitzen ein identisches Gewicht. (subjektiver Regionalbezug)
  
• Wissenschaftlicher Erkenntnisgewinn kennt keine disziplinären Grenzen. Es zählt die Kraft der Argumente. Berücksichtigung finden daher wissenschaftliche Arbeiten aller Genres (Dissertationen, Habilitationen, Monographien, Zeitschriftenartikel). (Gleichheitsbezug)
  

Der "Leipziger Wissenschaftspreis" wird durch eine Jury vergeben, die sich aus Vertretern der Preisgeber und renommierter Wissenschaftler zusammen setzt. Sie entwirft einen Bewertungskatalog, sichtet die eingehenden Arbeiten und wählt den jeweiligen Preisträger aus.